Δεν είναι τόσο το επιφανειακό χώμα όσο το νερό που είναι επικίνδυνο.Στην περίπτωση της πεδιάδας της Θήβας είναι ο υδροφόρος ορίζοντας που αντλούν το νερό για το πότισμα των κηπευτικών.Τα κηπευτικά καταναλώνουν πολύ νερό ιδιαίτερα το καλοκαίρι.Αν το χώμα που ήδη έχεις ή έχεις αγοράσει δεν έχει τοξικές ουσίες και το νερό που χρησιμοποιείς είναι πόσιμο τότε η παραγωγή σου θα είναι υγιεινή και αν θες βιολογική.Οι ανεξέλεγκτοι σκουπιδότοποι, μεταλλεία, πρατήρια βενζίνης, εργοστάσια χρωμάτων, και τα υγρά καθαρισμού ρούχων παράγουν τις πιο συνηθισμένες τοξικές ουσίες στον υδροφόρο ορίζοντα.