Αφού εγκαταστάθηκε στο Γκριν Χιλς, ο Σόνικ θέλει να αποδείξει πως είναι αληθινός ήρωας. Η ώρα για να δοκιμαστεί φτάνει με την επιστροφή του δρα Ρομπότνικ, ο οποίος αναζητά ένα σμαράγδι που έχει τη δύναμη να αφανίζει πολιτισμούς. Ο Σόνικ θα πρέπει να το βρει πρώτος, προκειμένου να σώσει τον κόσμο.